指定した領域の輝度変化グラフの作成方法

カルシウムイメージングでの蛍光強度変化のグラフをFiji ImageJで作ったときのメモ。

・選択領域輝度変化グラフ作成
1. Fiji ImageJにマルチtiffファイルをドラッグアンドドロップして取り込む。
2. 矩形ツールや楕円ツールボタンを押して調べたい領域を選択
3. Image→Stacks→Plot Z-axis Profile

・調べた領域の描画
1. Edit→Options→Line Width
  描画する線の太さを指定
2. Edit→Options→Colors…
  描画する線の色を指定。
 白黒の場合カラーの色を指定しても白黒になるので注意すること。
3. Edit→Draw

 

備考: 旧ブログ移植

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